Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C2orf88Q9BSF0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C2orf88Q9BSF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C2orf88Q9BSF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms