Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSF3RQ99062 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3RQ99062 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF3RQ99062 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms