Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PGBD1Q96JS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PGBD1Q96JS3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PGBD1Q96JS3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms