Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MRPL48Q96GC5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL48Q96GC5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL48Q96GC5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL48Q96GC5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms