Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP6V1E2Q96A05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP6V1E2Q96A05 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP6V1E2Q96A05 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms