Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A3Q92570 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A3Q92570 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR4A3Q92570 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR4A3Q92570 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms