Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF398Q8TD17 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF398Q8TD17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF398Q8TD17 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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