Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP4

MDGA1, MAM domain-containing glycosylphosphatidylinositol anchor protein 1, humanhuman

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Length 955 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDGA1Q8NFP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MDGA1Q8NFP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MDGA1Q8NFP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MDGA1Q8NFP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MDGA1Q8NFP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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