Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT1Q8IXI2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT1Q8IXI2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT1Q8IXI2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT1Q8IXI2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms