Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms