Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMCO3Q6UWJ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMCO3Q6UWJ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMCO3Q6UWJ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMCO3Q6UWJ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMCO3Q6UWJ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
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