Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5P6

TY4A-H, Transposon Ty4-H Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4A-HQ6Q5P6 MAK32YCR019W 1092 nt7.57□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 VPS65YLR322W 315 nt7.57□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 MRPS8YMR158W 468 nt7.57□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YNL017CYNL017C 339 nt7.57□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 SLD7YOR060C 774 nt7.57□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 ATG23YLR431C 1362 nt7.57□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 POX1YGL205W 2247 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 TDH1YJL052W 999 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 OAC1YKL120W 975 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 MCT1YOR221C 1083 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 OAZ1YPL052W 879 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 EFM1YHL039W 1758 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 FCY2YER056C 1602 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YFR006WYFR006W 1608 nt7.56□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 HXT8YJL214W 1710 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 MRP1YDR347W 966 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 RRP17YDR412W 708 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YJR115WYJR115W 510 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YLR112WYLR112W 420 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 RPS6AYPL090C 711 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 RPS6BYBR181C 711 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 ATP2YJR121W 1536 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 MKK1YOR231W 1527 nt7.55□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 DIT1YDR403W 1611 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 snR57snR57 88 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YHR140WYHR140W 720 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 HMS2YJR147W 1077 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 PRY2YKR013W 990 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YKR075CYKR075C 924 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 BTS1YPL069C 1008 nt7.54□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 PUP3YER094C 618 nt7.53□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YGR066CYGR066C 879 nt7.53□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 YBL070CYBL070C 321 nt7.53□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 GDH1YOR375C 1365 nt7.53□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 DML1YMR211W 1428 nt7.52□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 SHC1YER096W 1539 nt7.52□□□□□ -1.2
TY4A-HQ6Q5P6 VTS1YOR359W 1572 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YHR033WYHR033W 1272 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 CAR2YLR438W 1275 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 DCP1YOL149W 696 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 SSP2YOR242C 1116 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 IDI1YPL117C 867 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 SLM4YBR077C 489 nt7.52□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 GDA1YEL042W 1557 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 ELP4YPL101W 1371 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 ENT5YDR153C 1236 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YDR327WYDR327W 327 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 TAD2YJL035C 753 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 MFT1YML062C 1179 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 RRN10YBL025W 438 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YOL024WYOL024W 519 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 RRS1YOR294W 612 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 RHO1YPR165W 630 nt7.51□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 ACO1YLR304C 2337 nt7.5□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 RMD5YDR255C 1266 nt7.5□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 RRP46YGR095C 672 nt7.5□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YNL228WYNL228W 777 nt7.5□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 HEM15YOR176W 1182 nt7.5□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YGL260WYGL260W 231 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 BAG7YOR134W 1230 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 MNN9YPL050C 1188 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 CDC3YLR314C 1563 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YLL058WYLL058W 1728 nt7.49□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 CDC10YCR002C 969 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 RAM1YDL090C 1296 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YER138W-AYER138W-A 105 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YKL147CYKL147C 618 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 THI73YLR004C 1572 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 CTR3YLR411W 726 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 ECM2YBR065C 1095 nt7.48□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 PUS9YDL036C 1389 nt7.47□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YDL129WYDL129W 876 nt7.47□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 OKP1YGR179C 1221 nt7.47□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 YBR292CYBR292C 372 nt7.47□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 WHI4YDL224C 1950 nt7.47□□□□□ -1.21
TY4A-HQ6Q5P6 GCV1YDR019C 1203 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 YDR161WYDR161W 1164 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 YDR215CYDR215C 414 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 DST1YGL043W 930 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 AVO2YMR068W 1281 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 YAH1YPL252C 519 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 KAR1YNL188W 1302 nt7.46□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 TRP1YDR007W 675 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 ORM1YGR038W 669 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 YGR168CYGR168C 1131 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 CTK2YJL006C 972 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 ADE1YAR015W 921 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 ERV25YML012W 636 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 SMK1YPR054W 1167 nt7.45□□□□□ -1.22
TY4A-HQ6Q5P6 NMT1YLR195C 1368 nt7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.2 ms