Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO4Q6EEV6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SUMO4Q6EEV6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SUMO4Q6EEV6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SUMO4Q6EEV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms