Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNDC3AQ59EK9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3AQ59EK9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3AQ59EK9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms