Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VWA3BQ502W6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VWA3BQ502W6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VWA3BQ502W6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms