Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 ITR1YDR497C 1755 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YDR387CYDR387C 1668 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 UIP5YKR044W 1332 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YDL177CYDL177C 513 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YSC83YHR017W 1158 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YML018CYML018C 1182 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YHR020WYHR020W 2067 nt7.89□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 COQ1YBR003W 1422 nt7.88□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 AIM34YMR003W 597 nt7.88□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 AFG2YLR397C 2343 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 COX10YPL172C 1389 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 CEM1YER061C 1329 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YLR112WYLR112W 420 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 SNT309YPR101W 528 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 TOD6YBL054W 1578 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 YCR061WYCR061W 1896 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 PPM2YOL141W 2088 nt7.87□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 AMN1YBR158W 1650 nt7.86□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 NUP84YDL116W 2181 nt7.86□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 VMA3YEL027W 483 nt7.86□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 SNF4YGL115W 969 nt7.86□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 AVO2YMR068W 1281 nt7.86□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 PAC2YER007W 1557 nt7.85□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 GGC1YDL198C 903 nt7.85□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 CCT8YJL008C 1707 nt7.85□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 ZWF1YNL241C 1518 nt7.84□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 MRPL28YDR462W 444 nt7.84□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 MSP1YGR028W 1089 nt7.84□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 SCS7YMR272C 1155 nt7.84□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 RNH201YNL072W 924 nt7.84□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 CTF19YPL018W 1110 nt7.84□□□□□ -1.15
SNU66Q12420 CTF3YLR381W 2202 nt7.83□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 FSF1YOR271C 984 nt7.83□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 GPA1YHR005C 1419 nt7.82□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 QRI5YLR204W 336 nt7.82□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 ATG36YJL185C 882 nt7.81□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 RFC4YOL094C 972 nt7.81□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 CIT3YPR001W 1461 nt7.81□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 PPH22YDL188C 1134 nt7.8□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 SHO1YER118C 1104 nt7.8□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 MTR3YGR158C 753 nt7.8□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 HGH1YGR187C 1185 nt7.8□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 YMR295CYMR295C 594 nt7.8□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 MPC2YHR162W 390 nt7.79□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 MRPL10YNL284C 969 nt7.79□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 AIM2YAL049C 741 nt7.78□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 SGF29YCL010C 780 nt7.78□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 ATG22YCL038C 1587 nt7.78□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 YMR279CYMR279C 1623 nt7.78□□□□□ -1.16
SNU66Q12420 ADE17YMR120C 1779 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 CHA1YCL064C 1083 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 FAL1YDR021W 1200 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YER137CYER137C 447 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 LYS1YIR034C 1122 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 MSO1YNR049C 633 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 IRC11YOR013W 471 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YBR226CYBR226C 411 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 STT3YGL022W 2157 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YIL108WYIL108W 2091 nt7.77□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YOR012WYOR012W 414 nt7.76□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 CDC16YKL022C 2523 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 DID2YKR035W-A 615 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 MCH2YKL221W 1422 nt7.75□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 PRP2YNR011C 2631 nt7.74□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YJR146WYJR146W 354 nt7.74□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt7.74□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YPL257WYPL257W 582 nt7.74□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.73□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 RUF23RUF23 254 nt7.73□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 DFR1YOR236W 636 nt7.73□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 RGD2YFL047W 2145 nt7.73□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 PTC3YBL056W 1407 nt7.72□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 MED6YHR058C 888 nt7.72□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 SRL2YLR082C 1179 nt7.72□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 HBN1YCL026C-B 582 nt7.72□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 ARE2YNR019W 1929 nt7.72□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 YPR196WYPR196W 1413 nt7.71□□□□□ -1.17
SNU66Q12420 ERS1YCR075C 783 nt7.71□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 ARC35YNR035C 1029 nt7.71□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 AIM3YBR108W 2844 nt7.71□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 DSF1YEL070W 1509 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 YNR073CYNR073C 1509 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.7□□□□□ -1.18
SNU66Q12420 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.7□□□□□ -1.18
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