Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.51□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.51□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 PDA1YER178W 1263 nt5.51□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 TOS6YNL300W 309 nt5.51□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 CST26YBR042C 1194 nt5.51□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YHR020WYHR020W 2067 nt5.51□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 HED1YDR014W-A 489 nt5.5□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YPT1YFL038C 621 nt5.5□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YLL056CYLL056C 897 nt5.5□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YCL049CYCL049C 939 nt5.5□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 APE4YHR113W 1473 nt5.5□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 NAF1YNL124W 1479 nt5.5□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YLR162WYLR162W 357 nt5.49□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 TMA46YOR091W 1038 nt5.49□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 MBF1YOR298C-A 456 nt5.49□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 CYS3YAL012W 1185 nt5.48□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 AIM33YML087C 939 nt5.48□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YOR300WYOR300W 309 nt5.48□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 CLN1YMR199W 1641 nt5.48□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 FET4YMR319C 1659 nt5.47□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 PRI1YIR008C 1230 nt5.47□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.47□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 HEM1YDR232W 1647 nt5.47□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 EDE1YBL047C 4146 nt5.47□□□□□ -1.53
YPS3Q12303 SES1YDR023W 1389 nt5.46□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YHC3YJL059W 1227 nt5.46□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 ICP55YER078C 1536 nt5.46□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.45□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 KSH1YNL024C-A 219 nt5.45□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YPL041CYPL041C 624 nt5.45□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 SEC62YPL094C 825 nt5.45□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 GYP8YFL027C 1494 nt5.45□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 PRY3YJL078C 2646 nt5.44□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 FPR2YDR519W 408 nt5.44□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 GTT3YEL017W 1014 nt5.44□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 STT3YGL022W 2157 nt5.44□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.44□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 PHO3YBR092C 1404 nt5.44□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 AIM46YHR199C 933 nt5.43□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 FBA1YKL060C 1080 nt5.43□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 MIA40YKL195W 1212 nt5.43□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 SWD1YAR003W 1281 nt5.43□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 MSC3YLR219W 2187 nt5.43□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 FRE5YOR384W 2085 nt5.43□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 CCC2YDR270W 3015 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 COQ1YBR003W 1422 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 ERP2YAL007C 648 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 COX5AYNL052W 462 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YPR076WYPR076W 375 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YBR113WYBR113W 483 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 PMT3YOR321W 2262 nt5.42□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 EDC2YER035W 438 nt5.41□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 RPP1YHR062C 882 nt5.41□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 HMS2YJR147W 1077 nt5.41□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 RFC4YOL094C 972 nt5.41□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 COX10YPL172C 1389 nt5.41□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 NUP49YGL172W 1419 nt5.4□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 PUP2YGR253C 783 nt5.4□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YNL092WYNL092W 1203 nt5.4□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 FIT2YOR382W 462 nt5.4□□□□□ -1.54
YPS3Q12303 YJL163CYJL163C 1668 nt5.4□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 RBS1YDL189W 1374 nt5.4□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 THI2YBR240C 1353 nt5.4□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 DOT1YDR440W 1749 nt5.39□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 MIP1YOR330C 3765 nt5.39□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 UTR2YEL040W 1404 nt5.39□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 SQT1YIR012W 1296 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 TPK1YJL164C 1194 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YJR146WYJR146W 354 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YOX1YML027W 1158 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 OGG1YML060W 1131 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YNL120CYNL120C 486 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 DFR1YOR236W 636 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 MFG1YDL233W 1377 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 NMT1YLR195C 1368 nt5.38□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 AGX1YFL030W 1158 nt5.37□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 PEX3YDR329C 1326 nt5.37□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 MSY1YPL097W 1479 nt5.37□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 ATG22YCL038C 1587 nt5.37□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 GLN3YER040W 2193 nt5.36□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 SML1YML058W 315 nt5.36□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 LAT1YNL071W 1449 nt5.36□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 VMA2YBR127C 1554 nt5.36□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 SLX5YDL013W 1860 nt5.36□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YHK8YHR048W 1545 nt5.35□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 PPH21YDL134C 1110 nt5.35□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YBL070CYBL070C 321 nt5.35□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YOL046CYOL046C 675 nt5.35□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YPR204WYPR204W 3099 nt5.35□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 YLR123CYLR123C 330 nt5.34□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 IDP3YNL009W 1263 nt5.34□□□□□ -1.55
YPS3Q12303 MPA43YNL249C 1629 nt5.34□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 ARG81YML099C 2643 nt5.33□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 ICS3YJL077C 396 nt5.33□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 YUR1YJL139C 1287 nt5.33□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 PRE5YMR314W 705 nt5.33□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 RUF23RUF23 254 nt5.33□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 YPL257WYPL257W 582 nt5.33□□□□□ -1.56
YPS3Q12303 HXT15YDL245C 1704 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 278.4 ms