Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 NTG1YAL015C 1200 nt6.43□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 MRPS18YNL306W 654 nt6.43□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SRF1YDL133W 1314 nt6.43□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 ECM30YLR436C 3825 nt6.43□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 COQ1YBR003W 1422 nt6.42□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YHK8YHR048W 1545 nt6.42□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 BIM1YER016W 1035 nt6.42□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 IRC11YOR013W 471 nt6.42□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YRB2YIL063C 984 nt6.41□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 COX16YJL003W 357 nt6.41□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YKL077WYKL077W 1179 nt6.41□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 GCN3YKR026C 918 nt6.41□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 COX10YPL172C 1389 nt6.41□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 YNR014WYNR014W 639 nt6.4□□□□□ -1.38
RRP42Q12277 SAL1YNL083W 1485 nt6.4□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 PRY3YJL078C 2646 nt6.39□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.39□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.39□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 YAR064WYAR064W 300 nt6.39□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 KIN1YDR122W 3195 nt6.39□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 IMG1YCR046C 510 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 PPH22YDL188C 1134 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 MEU1YLR017W 1014 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 RFC4YOL094C 972 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 MRPL23YOR150W 492 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 ILV6YCL009C 930 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 PAB1YER165W 1734 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 GSH1YJL101C 2037 nt6.38□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 STT3YGL022W 2157 nt6.37□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 GCG1YER163C 699 nt6.37□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 EDE1YBL047C 4146 nt6.36□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 PEX31YGR004W 1389 nt6.36□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 AIM20YIL158W 615 nt6.36□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 KSH1YNL024C-A 219 nt6.36□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 HIS1YER055C 894 nt6.35□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 OM45YIL136W 1182 nt6.35□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 CUE4YML101C 354 nt6.35□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 CBK1YNL161W 2271 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 EFM1YHL039W 1758 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 YDR415CYDR415C 1125 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 YJR146WYJR146W 354 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 OPI11YPR044C 354 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 SEC23YPR181C 2307 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 SLA2YNL243W 2907 nt6.34□□□□□ -1.39
RRP42Q12277 EMP65YER140W 1671 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 SKY1YMR216C 2229 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 MIA40YKL195W 1212 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YKR032WYKR032W 315 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 RUF23RUF23 254 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 DFR1YOR236W 636 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 RPL5YPL131W 894 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YPL257WYPL257W 582 nt6.33□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 GPH1YPR160W 2709 nt6.32□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 FAL1YDR021W 1200 nt6.32□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 DYS1YHR068W 1164 nt6.32□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YJR107WYJR107W 987 nt6.32□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 OGG1YML060W 1131 nt6.32□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 ADH5YBR145W 1056 nt6.32□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 UBP13YBL067C 2244 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YPT1YFL038C 621 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 LYS1YIR034C 1122 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 SRY1YKL218C 981 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 MHT1YLL062C 975 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 DPH5YLR172C 903 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 TOS6YNL300W 309 nt6.31□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 HEM1YDR232W 1647 nt6.3□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 VMA3YEL027W 483 nt6.3□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 ERG8YMR220W 1356 nt6.3□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 RSP5YER125W 2430 nt6.29□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YKL153WYKL153W 510 nt6.29□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 OPI8YKR035C 642 nt6.29□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 SCS22YBL091C-A 528 nt6.29□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 CTF19YPL018W 1110 nt6.29□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 YKR045CYKR045C 552 nt6.28□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 CCT8YJL008C 1707 nt6.28□□□□□ -1.4
RRP42Q12277 RQC1YDR333C 2172 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 YLL066CYLL066C 3618 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 PMP3YDR276C 168 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 OPI7YDR360W 435 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 DID2YKR035W-A 615 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 TSR2YLR435W 618 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 YNL120CYNL120C 486 nt6.27□□□□□ -1.41
RRP42Q12277 DAL4YIR028W 1908 nt6.27□□□□□ -1.41
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