Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC3A1Q07837 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC3A1Q07837 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC3A1Q07837 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms