Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR407WQ06070 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR407WQ06070 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR407WQ06070 YKL077WYKL077W 1179 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR407WQ06070 TMA46YOR091W 1038 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR407WQ06070 COQ1YBR003W 1422 nt7.59□□□□□ -1.19
YLR407WQ06070 LCL3YGL085W 825 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 ATG36YJL185C 882 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 RPL5YPL131W 894 nt7.58□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 YJL211CYJL211C 444 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 SWD1YAR003W 1281 nt7.57□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 PPH22YDL188C 1134 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 TOS6YNL300W 309 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 MRPL23YOR150W 492 nt7.56□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 RQC1YDR333C 2172 nt7.55□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 HEM2YGL040C 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 YJR107WYJR107W 987 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 YBR113WYBR113W 483 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 ADH5YBR145W 1056 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 MIP1YOR330C 3765 nt7.54□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 SWP1YMR149W 861 nt7.53□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 EEB1YPL095C 1371 nt7.53□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 HEM1YDR232W 1647 nt7.52□□□□□ -1.2
YLR407WQ06070 SAL1YNL083W 1485 nt7.52□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YNL040WYNL040W 1371 nt7.52□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 DID2YKR035W-A 615 nt7.52□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 ILV6YCL009C 930 nt7.52□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 EDE1YBL047C 4146 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YPL277CYPL277C 1464 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YDR415CYDR415C 1125 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YPT1YFL038C 621 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 GCN3YKR026C 918 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YOR111WYOR111W 699 nt7.51□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 ASF1YJL115W 840 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 RNH1YMR234W 1047 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 OPI11YPR044C 354 nt7.5□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YRB2YIL063C 984 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 OGG1YML060W 1131 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 TAF9YMR236W 474 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 CCC2YDR270W 3015 nt7.49□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 COX10YPL172C 1389 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YJR146WYJR146W 354 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YAR064WYAR064W 300 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 RFC4YOL094C 972 nt7.48□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 AFG2YLR397C 2343 nt7.47□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 YKR023WYKR023W 1593 nt7.47□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 FMO1YHR176W 1299 nt7.47□□□□□ -1.21
YLR407WQ06070 FBA1YKL060C 1080 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 OPI8YKR035C 642 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YNL120CYNL120C 486 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 DFR1YOR236W 636 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YOR389WYOR389W 1875 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YHK8YHR048W 1545 nt7.46□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 MIA40YKL195W 1212 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 KSH1YNL024C-A 219 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 MRPS18YNL306W 654 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YLR173WYLR173W 1827 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YIL108WYIL108W 2091 nt7.45□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 ECM27YJR106W 2178 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 HIS1YER055C 894 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 CUE4YML101C 354 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 TOM71YHR117W 1920 nt7.44□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 MAK32YCR019W 1092 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 HSP12YFL014W 330 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 SMK1YPR054W 1167 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 GPD2YOL059W 1323 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 MSY1YPL097W 1479 nt7.43□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 GCG1YER163C 699 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YKR045CYKR045C 552 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 ECM38YLR299W 1983 nt7.42□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 VMA3YEL027W 483 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YKR032WYKR032W 315 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 RRN10YBL025W 438 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 THI2YBR240C 1353 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 CCT8YJL008C 1707 nt7.41□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 PRY3YJL078C 2646 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 IMG1YCR046C 510 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 SQT1YIR012W 1296 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 YPL257WYPL257W 582 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 PZF1YPR186C 1290 nt7.4□□□□□ -1.22
YLR407WQ06070 ADE2YOR128C 1716 nt7.4□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 FRA1YLL029W 2250 nt7.39□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 FAL1YDR021W 1200 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 OM45YIL136W 1182 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 AIM20YIL158W 615 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 MHT1YLL062C 975 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 TSR2YLR435W 618 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 YBL112CYBL112C 318 nt7.38□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 LYS1YIR034C 1122 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 HMT1YBR034C 1047 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 CTF19YPL018W 1110 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 PMT3YOR321W 2262 nt7.37□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 RBS1YDL189W 1374 nt7.36□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 RPP1YHR062C 882 nt7.36□□□□□ -1.23
YLR407WQ06070 YKL153WYKL153W 510 nt7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms