Protein–RNA interactions for Protein: Q03280

TOM1, E3 ubiquitin-protein ligase TOM1, yeastyeast

Predictions only

Length 3,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOM1Q03280 YMR209CYMR209C 1374 nt7.22□□□□□ -1.25
TOM1Q03280 YGL114WYGL114W 2178 nt7.22□□□□□ -1.25
TOM1Q03280 TMA46YOR091W 1038 nt7.21□□□□□ -1.25
TOM1Q03280 TPO4YOR273C 1980 nt7.21□□□□□ -1.25
TOM1Q03280 ERG24YNL280C 1317 nt7.21□□□□□ -1.25
TOM1Q03280 PRS2YER099C 957 nt7.2□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 AMD2YDR242W 1650 nt7.2□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 RPP1YHR062C 882 nt7.19□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 DCN1YLR128W 810 nt7.19□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YOR041CYOR041C 432 nt7.19□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YET3YDL072C 612 nt7.19□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YBR241CYBR241C 1467 nt7.18□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 RIM8YGL045W 1629 nt7.18□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 DAP1YPL170W 459 nt7.18□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt7.17□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YSC83YHR017W 1158 nt7.17□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 THR1YHR025W 1074 nt7.17□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 MAK31YCR020C-A 267 nt7.16□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt7.16□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.16□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 RUP1YOR138C 2016 nt7.16□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 CBP4YGR174C 513 nt7.16□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 ADE12YNL220W 1302 nt7.16□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 MRPS28YDR337W 861 nt7.15□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 LIP5YOR196C 1245 nt7.15□□□□□ -1.26
TOM1Q03280 MRPL22YNL177C 930 nt7.15□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 CWC21YDR482C 408 nt7.14□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 GTO3YMR251W 1101 nt7.14□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 CTA1YDR256C 1548 nt7.14□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 CRF1YDR223W 1404 nt7.14□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 YJR084WYJR084W 1272 nt7.13□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 FCY2YER056C 1602 nt7.13□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 COX20YDR231C 618 nt7.13□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 MRK1YDL079C 1506 nt7.13□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 PYC2YBR218C 3543 nt7.12□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 LST8YNL006W 912 nt7.11□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 YHK8YHR048W 1545 nt7.1□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 RFS1YBR052C 633 nt7.1□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 ATG12YBR217W 561 nt7.1□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 YLR283WYLR283W 945 nt7.1□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 JNM1YMR294W 1122 nt7.1□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 KNH1YDL049C 807 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 YMR010WYMR010W 1218 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 PUF3YLL013C 2640 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 LYS1YIR034C 1122 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 MSO1YNR049C 633 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 COQ1YBR003W 1422 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 MDM31YHR194W 1740 nt7.09□□□□□ -1.27
TOM1Q03280 LCB3YJL134W 1230 nt7.09□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 YKL031WYKL031W 414 nt7.09□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 DUR3YHL016C 2208 nt7.09□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 CTF19YPL018W 1110 nt7.08□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 YMR155WYMR155W 1644 nt7.08□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 TEA1YOR337W 2280 nt7.08□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 ECM14YHR132C 1293 nt7.07□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 RPS3YNL178W 723 nt7.07□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 EXG2YDR261C 1689 nt7.06□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 COX10YPL172C 1389 nt7.06□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 VBA5YKR105C 1749 nt7.06□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 YFL064CYFL064C 525 nt7.05□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 YPR202WYPR202W 717 nt7.05□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 CEM1YER061C 1329 nt7.05□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 SGF73YGL066W 1974 nt7.04□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 SNO4YMR322C 714 nt7.04□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 HSP33YOR391C 714 nt7.04□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 HSP32YPL280W 714 nt7.04□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 HSM3YBR272C 1443 nt7.03□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 TPI1YDR050C 747 nt7.03□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 ATP10YLR393W 840 nt7.03□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 COR1YBL045C 1374 nt7.03□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 SNA3YJL151C 402 nt7.03□□□□□ -1.28
TOM1Q03280 GAT3YLR013W 426 nt7.02□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 SNF7YLR025W 723 nt7.02□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 ATG33YLR356W 594 nt7.01□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 OGG1YML060W 1131 nt7.01□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 YJR015WYJR015W 1533 nt7□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 DID2YKR035W-A 615 nt7□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 MRM2YGL136C 963 nt7□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 AAD15YOL165C 432 nt7□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 RSC9YML127W 1746 nt6.99□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 GPH1YPR160W 2709 nt6.99□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 HMG2YLR450W 3138 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 COX9YDL067C 180 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 MLC1YGL106W 450 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 URH1YDR400W 1023 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 YNL296WYNL296W 315 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 YPL062WYPL062W 405 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 YCL041CYCL041C 495 nt6.98□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 YLR194CYLR194C 765 nt6.97□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 ECM15YBL001C 315 nt6.96□□□□□ -1.29
TOM1Q03280 MDH3YDL078C 1032 nt6.96□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 FLC2YAL053W 2352 nt6.96□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 PMT7YDR307W 1989 nt6.95□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 CIS3YJL158C 684 nt6.95□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 PMA2YPL036W 2844 nt6.95□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 YGL260WYGL260W 231 nt6.95□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 PYK2YOR347C 1521 nt6.95□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 RPS5YJR123W 678 nt6.94□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 SPC34YKR037C 888 nt6.94□□□□□ -1.3
TOM1Q03280 MRPS16YPL013C 366 nt6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.7 ms