Protein–RNA interactions for Protein: Q00578

SSL2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSL2Q00578 YGL102CYGL102C 429 nt7.47□□□□□ -1.21
SSL2Q00578 YML079WYML079W 606 nt7.47□□□□□ -1.21
SSL2Q00578 PRS4YBL068W 981 nt7.47□□□□□ -1.21
SSL2Q00578 HOG1YLR113W 1308 nt7.47□□□□□ -1.21
SSL2Q00578 STF1YDL130W-A 261 nt7.46□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YDR415CYDR415C 1125 nt7.46□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YLR162WYLR162W 357 nt7.46□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YLR312CYLR312C 1197 nt7.46□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 PMT3YOR321W 2262 nt7.46□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 CIR2YOR356W 1896 nt7.45□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YPT1YFL038C 621 nt7.45□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 HAL5YJL165C 2568 nt7.44□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 FBA1YKL060C 1080 nt7.44□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 CMK2YOL016C 1344 nt7.44□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 COQ1YBR003W 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 PHO3YBR092C 1404 nt7.44□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YCR061WYCR061W 1896 nt7.43□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 HED1YDR014W-A 489 nt7.43□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YJL144WYJL144W 315 nt7.43□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YBR113WYBR113W 483 nt7.43□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 SES1YDR023W 1389 nt7.43□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 FPR2YDR519W 408 nt7.42□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 PUP2YGR253C 783 nt7.42□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YMR034CYMR034C 1305 nt7.42□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 UTR2YEL040W 1404 nt7.42□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 NUP49YGL172W 1419 nt7.42□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 SGV1YPR161C 1974 nt7.41□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YKL077WYKL077W 1179 nt7.41□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 PEX13YLR191W 1161 nt7.41□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 ATG22YCL038C 1587 nt7.41□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.4□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 YKR032WYKR032W 315 nt7.4□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 ZIM17YNL310C 525 nt7.4□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 MSY1YPL097W 1479 nt7.4□□□□□ -1.22
SSL2Q00578 EMP65YER140W 1671 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 VTS1YOR359W 1572 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 THI2YBR240C 1353 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 SQT1YIR012W 1296 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 CUE4YML101C 354 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YNL092WYNL092W 1203 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YNL120CYNL120C 486 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 EDE1YBL047C 4146 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 AVT4YNL101W 2142 nt7.39□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 AGP2YBR132C 1791 nt7.38□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 MIA40YKL195W 1212 nt7.38□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YHM2YMR241W 945 nt7.38□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 PPM2YOL141W 2088 nt7.37□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.37□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 SRN2YLR119W 642 nt7.37□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 MFG1YDL233W 1377 nt7.36□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YJL163CYJL163C 1668 nt7.36□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 CCC2YDR270W 3015 nt7.36□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 BNS1YGR230W 414 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 PUS5YLR165C 765 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 SML1YML058W 315 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 AIM33YML087C 939 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 MRPL23YOR150W 492 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 FIT2YOR382W 462 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 HEL1YKR017C 1656 nt7.35□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YLL056CYLL056C 897 nt7.34□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YLR123CYLR123C 330 nt7.34□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 YOL046CYOL046C 675 nt7.34□□□□□ -1.23
SSL2Q00578 FAF1YIL019W 1041 nt7.33□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 BMT5YIL096C 1011 nt7.33□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 TMA46YOR091W 1038 nt7.33□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 ERG10YPL028W 1197 nt7.33□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 CRP1YHR146W 1398 nt7.33□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 ERG12YMR208W 1332 nt7.32□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 REC114YMR133W 1287 nt7.32□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 RPR1RPR1 369 nt7.32□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 RPP1YHR062C 882 nt7.31□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.31□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YUR1YJL139C 1287 nt7.31□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 AGX1YFL030W 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 SWD1YAR003W 1281 nt7.3□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YOR300WYOR300W 309 nt7.3□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.3□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YEN1YER041W 2280 nt7.3□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 TOS2YGR221C 1869 nt7.3□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 VMA2YBR127C 1554 nt7.29□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 ISC1YER019W 1434 nt7.29□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YJR146WYJR146W 354 nt7.29□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.29□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 IDP3YNL009W 1263 nt7.29□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 KDX1YKL161C 1302 nt7.28□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 KNS1YLL019C 2214 nt7.28□□□□□ -1.24
SSL2Q00578 AIM46YHR199C 933 nt7.27□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 ICS3YJL077C 396 nt7.27□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 ATG36YJL185C 882 nt7.27□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 YKL102CYKL102C 306 nt7.27□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 RFC4YOL094C 972 nt7.27□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 PFK2YMR205C 2880 nt7.26□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 ATG17YLR423C 1254 nt7.26□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 YOX1YML027W 1158 nt7.26□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 OGG1YML060W 1131 nt7.26□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 HSM3YBR272C 1443 nt7.26□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 GEF1YJR040W 2340 nt7.26□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 YGR054WYGR054W 1929 nt7.25□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 FHN1YGR131W 525 nt7.25□□□□□ -1.25
SSL2Q00578 DPH5YLR172C 903 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms