Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIRPAP78324 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIRPAP78324 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIRPAP78324 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIRPAP78324 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms