Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVFRD-1P60508 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVFRD-1P60508 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVFRD-1P60508 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVFRD-1P60508 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms