Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF10P55107 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF10P55107 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF10P55107 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF10P55107 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF10P55107 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF10P55107 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF10P55107 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF10P55107 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF10P55107 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF10P55107 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF10P55107 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF10P55107 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF10P55107 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF10P55107 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF10P55107 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF10P55107 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF10P55107 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF10P55107 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF10P55107 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF10P55107 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDF10P55107 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDF10P55107 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF10P55107 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF10P55107 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF10P55107 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF10P55107 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDF10P55107 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF10P55107 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF10P55107 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF10P55107 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDF10P55107 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF10P55107 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF10P55107 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF10P55107 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF10P55107 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF10P55107 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDF10P55107 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF10P55107 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF10P55107 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF10P55107 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF10P55107 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF10P55107 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDF10P55107 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GDF10P55107 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF10P55107 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF10P55107 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF10P55107 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF10P55107 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GDF10P55107 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GDF10P55107 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDF10P55107 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF10P55107 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF10P55107 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF10P55107 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF10P55107 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDF10P55107 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GDF10P55107 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms