Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPOLAP51003 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPOLAP51003 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPOLAP51003 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAPOLAP51003 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms