Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNTAP49354 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNTAP49354 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNTAP49354 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNTAP49354 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNTAP49354 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNTAP49354 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNTAP49354 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNTAP49354 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNTAP49354 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNTAP49354 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNTAP49354 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNTAP49354 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNTAP49354 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNTAP49354 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNTAP49354 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNTAP49354 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNTAP49354 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNTAP49354 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNTAP49354 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNTAP49354 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FNTAP49354 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNTAP49354 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNTAP49354 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNTAP49354 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FNTAP49354 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNTAP49354 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNTAP49354 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNTAP49354 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNTAP49354 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FNTAP49354 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNTAP49354 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNTAP49354 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNTAP49354 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNTAP49354 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNTAP49354 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNTAP49354 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNTAP49354 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNTAP49354 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNTAP49354 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNTAP49354 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNTAP49354 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNTAP49354 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNTAP49354 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNTAP49354 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNTAP49354 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNTAP49354 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNTAP49354 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNTAP49354 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNTAP49354 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNTAP49354 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNTAP49354 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNTAP49354 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNTAP49354 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNTAP49354 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNTAP49354 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNTAP49354 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNTAP49354 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNTAP49354 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNTAP49354 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNTAP49354 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNTAP49354 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNTAP49354 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNTAP49354 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms