Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER4P35408 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTGER4P35408 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER4P35408 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER4P35408 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms