Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDELR2P33947 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDELR2P33947 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDELR2P33947 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms