Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VARSP26640 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VARSP26640 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VARSP26640 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VARSP26640 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VARSP26640 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VARSP26640 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VARSP26640 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VARSP26640 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VARSP26640 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VARSP26640 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VARSP26640 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VARSP26640 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VARSP26640 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VARSP26640 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VARSP26640 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VARSP26640 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VARSP26640 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VARSP26640 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VARSP26640 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VARSP26640 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VARSP26640 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VARSP26640 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VARSP26640 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VARSP26640 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VARSP26640 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VARSP26640 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VARSP26640 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VARSP26640 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VARSP26640 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VARSP26640 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
VARSP26640 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VARSP26640 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VARSP26640 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VARSP26640 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VARSP26640 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VARSP26640 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VARSP26640 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VARSP26640 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VARSP26640 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VARSP26640 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VARSP26640 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VARSP26640 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VARSP26640 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VARSP26640 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VARSP26640 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VARSP26640 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VARSP26640 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VARSP26640 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VARSP26640 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VARSP26640 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VARSP26640 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VARSP26640 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VARSP26640 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VARSP26640 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VARSP26640 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VARSP26640 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VARSP26640 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VARSP26640 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VARSP26640 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VARSP26640 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VARSP26640 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VARSP26640 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VARSP26640 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VARSP26640 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms