Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCN1P20061 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCN1P20061 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCN1P20061 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCN1P20061 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCN1P20061 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCN1P20061 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCN1P20061 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCN1P20061 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCN1P20061 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCN1P20061 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCN1P20061 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCN1P20061 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCN1P20061 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN1P20061 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN1P20061 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCN1P20061 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCN1P20061 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN1P20061 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCN1P20061 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN1P20061 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN1P20061 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN1P20061 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN1P20061 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCN1P20061 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCN1P20061 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN1P20061 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN1P20061 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN1P20061 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN1P20061 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCN1P20061 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCN1P20061 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN1P20061 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN1P20061 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN1P20061 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN1P20061 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN1P20061 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCN1P20061 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCN1P20061 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCN1P20061 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCN1P20061 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TCN1P20061 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN1P20061 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN1P20061 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCN1P20061 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN1P20061 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms