Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ELK1P19419 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ELK1P19419 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ELK1P19419 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ELK1P19419 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELK1P19419 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELK1P19419 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELK1P19419 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ELK1P19419 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ELK1P19419 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ELK1P19419 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELK1P19419 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELK1P19419 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELK1P19419 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELK1P19419 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ELK1P19419 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ELK1P19419 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ELK1P19419 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELK1P19419 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELK1P19419 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELK1P19419 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELK1P19419 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ELK1P19419 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELK1P19419 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELK1P19419 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELK1P19419 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ELK1P19419 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ELK1P19419 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELK1P19419 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ELK1P19419 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ELK1P19419 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK1P19419 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK1P19419 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK1P19419 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK1P19419 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK1P19419 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ELK1P19419 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK1P19419 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ELK1P19419 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms