Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB1P18505 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB1P18505 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms