Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GM2AP17900 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GM2AP17900 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GM2AP17900 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GM2AP17900 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GM2AP17900 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GM2AP17900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GM2AP17900 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GM2AP17900 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GM2AP17900 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GM2AP17900 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GM2AP17900 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GM2AP17900 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GM2AP17900 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GM2AP17900 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GM2AP17900 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GM2AP17900 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GM2AP17900 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GM2AP17900 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GM2AP17900 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GM2AP17900 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GM2AP17900 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GM2AP17900 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GM2AP17900 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GM2AP17900 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GM2AP17900 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GM2AP17900 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GM2AP17900 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GM2AP17900 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GM2AP17900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GM2AP17900 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GM2AP17900 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GM2AP17900 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GM2AP17900 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GM2AP17900 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GM2AP17900 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GM2AP17900 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GM2AP17900 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GM2AP17900 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GM2AP17900 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GM2AP17900 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GM2AP17900 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GM2AP17900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GM2AP17900 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GM2AP17900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GM2AP17900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GM2AP17900 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GM2AP17900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GM2AP17900 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GM2AP17900 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GM2AP17900 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GM2AP17900 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GM2AP17900 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GM2AP17900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GM2AP17900 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GM2AP17900 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GM2AP17900 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GM2AP17900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GM2AP17900 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GM2AP17900 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GM2AP17900 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GM2AP17900 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GM2AP17900 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GM2AP17900 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GM2AP17900 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GM2AP17900 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GM2AP17900 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GM2AP17900 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GM2AP17900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GM2AP17900 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GM2AP17900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GM2AP17900 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GM2AP17900 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GM2AP17900 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GM2AP17900 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms