Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD44P16070 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD44P16070 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD44P16070 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD44P16070 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CD44P16070 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD44P16070 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD44P16070 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD44P16070 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD44P16070 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD44P16070 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD44P16070 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD44P16070 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD44P16070 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD44P16070 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD44P16070 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD44P16070 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD44P16070 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD44P16070 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD44P16070 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD44P16070 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD44P16070 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD44P16070 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD44P16070 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD44P16070 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD44P16070 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD44P16070 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD44P16070 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CD44P16070 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CD44P16070 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CD44P16070 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD44P16070 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD44P16070 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD44P16070 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD44P16070 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD44P16070 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD44P16070 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD44P16070 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD44P16070 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD44P16070 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD44P16070 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD44P16070 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD44P16070 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD44P16070 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD44P16070 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD44P16070 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD44P16070 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD44P16070 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD44P16070 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD44P16070 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD44P16070 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CD44P16070 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD44P16070 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CD44P16070 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD44P16070 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD44P16070 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD44P16070 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD44P16070 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD44P16070 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD44P16070 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CD44P16070 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD44P16070 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD44P16070 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CD44P16070 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CD44P16070 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD44P16070 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD44P16070 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CD44P16070 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CD44P16070 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD44P16070 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD44P16070 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CD44P16070 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms