Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VPREB1P12018 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VPREB1P12018 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VPREB1P12018 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms