Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RD3LP0DJH9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RD3LP0DJH9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RD3LP0DJH9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms