Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPSAP08865 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPSAP08865 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPSAP08865 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPSAP08865 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPSAP08865 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPSAP08865 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPSAP08865 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPSAP08865 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPSAP08865 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPSAP08865 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPSAP08865 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPSAP08865 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPSAP08865 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPSAP08865 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPSAP08865 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPSAP08865 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPSAP08865 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPSAP08865 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPSAP08865 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPSAP08865 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPSAP08865 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPSAP08865 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPSAP08865 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPSAP08865 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPSAP08865 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPSAP08865 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPSAP08865 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPSAP08865 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPSAP08865 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPSAP08865 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPSAP08865 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPSAP08865 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPSAP08865 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPSAP08865 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPSAP08865 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPSAP08865 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPSAP08865 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPSAP08865 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPSAP08865 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPSAP08865 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPSAP08865 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPSAP08865 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPSAP08865 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPSAP08865 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPSAP08865 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPSAP08865 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPSAP08865 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPSAP08865 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPSAP08865 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPSAP08865 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms