Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTCP00480 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTCP00480 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTCP00480 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTCP00480 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTCP00480 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTCP00480 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTCP00480 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTCP00480 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTCP00480 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTCP00480 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTCP00480 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTCP00480 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTCP00480 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTCP00480 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTCP00480 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTCP00480 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTCP00480 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTCP00480 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTCP00480 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTCP00480 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTCP00480 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OTCP00480 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTCP00480 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTCP00480 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTCP00480 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTCP00480 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTCP00480 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTCP00480 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTCP00480 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTCP00480 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTCP00480 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTCP00480 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTCP00480 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTCP00480 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTCP00480 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTCP00480 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTCP00480 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTCP00480 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTCP00480 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTCP00480 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTCP00480 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTCP00480 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTCP00480 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTCP00480 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTCP00480 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTCP00480 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTCP00480 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTCP00480 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTCP00480 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTCP00480 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms