Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FOXO3O43524 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FOXO3O43524 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FOXO3O43524 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
FOXO3O43524 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms