Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB6O15197 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPHB6O15197 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB6O15197 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHB6O15197 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB6O15197 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms