Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC28A1O00337 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC28A1O00337 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC28A1O00337 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC28A1O00337 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms