Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLCA1A8K7I4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLCA1A8K7I4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLCA1A8K7I4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms