Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A6NL46 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A6NL46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A6NL46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NL46 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NL46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NL46 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NL46 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NL46 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A6NL46 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A6NL46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
A6NL46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A6NL46 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A6NL46 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NL46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NL46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NL46 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NL46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NL46 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A6NL46 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A6NL46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A6NL46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A6NL46 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A6NL46 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NL46 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NL46 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A6NL46 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NL46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NL46 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NL46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NL46 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NL46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NL46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NL46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NL46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NL46 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NL46 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NL46 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NL46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NL46 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NL46 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NL46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NL46 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NL46 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms