Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
A6NDN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A6NDN8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A6NDN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A6NDN8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A6NDN8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A6NDN8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A6NDN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A6NDN8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A6NDN8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A6NDN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A6NDN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
A6NDN8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A6NDN8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A6NDN8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NDN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
A6NDN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NDN8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NDN8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NDN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NDN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
A6NDN8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A6NDN8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A6NDN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A6NDN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A6NDN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms