Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf170A2RU37 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C9orf170A2RU37 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C9orf170A2RU37 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf170A2RU37 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms