Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IRGMA1A4Y4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRGMA1A4Y4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRGMA1A4Y4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRGMA1A4Y4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms