Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K4Q9Y6R4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms