Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGEF2Q9Y6D5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARFGEF2Q9Y6D5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms