Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYVE1Q9Y5Y7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms